通過(guò)圖注意力網(wǎng)絡(luò)識(shí)別空間轉(zhuǎn)錄組中的空間域
生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志
頁(yè)數(shù): 7 2024-04-11
摘要: 由于數(shù)據(jù)的高維和復(fù)雜性,空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析一直是一個(gè)具有挑戰(zhàn)性的問(wèn)題,而聚類(lèi)分析則是空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的核心問(wèn)題。本文提出了一種基于圖注意力網(wǎng)絡(luò)的深度學(xué)習(xí)方法,用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的聚類(lèi)分析。首先,對(duì)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行增強(qiáng),然后使用圖注意力網(wǎng)絡(luò)對(duì)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行特征提取,最后使用萊頓(Leiden)算法進(jìn)行聚類(lèi)分析。通過(guò)聚類(lèi)的評(píng)價(jià)指標(biāo)發(fā)現(xiàn),與傳統(tǒng)的非空間及空間聚類(lèi)方法相比,本文提出的方... (共7頁(yè))