基于Nanopore測(cè)序技術(shù)分析廣東地區(qū)1株P(guān)RRSV-2的基因組特征
中國(guó)獸醫(yī)雜志
頁(yè)數(shù): 9 2024-09-12
摘要: 為促進(jìn)Nanopore測(cè)序技術(shù)在美洲型豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV-2)全基因組測(cè)序中的應(yīng)用并進(jìn)一步了解當(dāng)前廣東地區(qū)PRRSV-2全基因組特征,本試驗(yàn)從廣東地區(qū)某屠宰場(chǎng)采集1份PRRSV-2陽(yáng)性樣本,提取核酸進(jìn)行靶向擴(kuò)增,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序,使用Samtools和Medaka等軟件對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析和拼接,得到樣本的全基因組序列。選取5′端1~4 50... (共9頁(yè))